Protein–RNA interactions for Protein: F8VVB4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8VVB4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
F8VVB4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
F8VVB4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
F8VVB4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
F8VVB4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
F8VVB4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
F8VVB4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F8VVB4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F8VVB4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F8VVB4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
F8VVB4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F8VVB4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms