Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PATL2C9JE40 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PATL2C9JE40 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms