Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HMGB1P1B2RPK0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMGB1P1B2RPK0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms