Protein–RNA interactions for Protein: A6NNZ2

Tubulin beta-8 chain-like protein LOC260334, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NNZ2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A6NNZ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A6NNZ2 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NNZ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NNZ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NNZ2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A6NNZ2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A6NNZ2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A6NNZ2 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A6NNZ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A6NNZ2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms