Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HMX3A6NHT5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HMX3A6NHT5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms