Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC160A6NGH7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC160A6NGH7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms