Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms