Protein–RNA interactions for Protein: A6NC62

RBAKDN, Putative RBAK downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBAKDNA6NC62 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RBAKDNA6NC62 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAKDNA6NC62 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAKDNA6NC62 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RBAKDNA6NC62 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms