Protein–RNA interactions for Protein: A4QPB2

LRP5L, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5LA4QPB2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRP5LA4QPB2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRP5LA4QPB2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms