Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LCHNA4D1U4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LCHNA4D1U4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms