Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
VWA8A3KMH1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
VWA8A3KMH1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms