Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SSPOA2VEC9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms