Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TMEM89A2RUT3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM89A2RUT3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms