Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMX2A2RU54 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HMX2A2RU54 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMX2A2RU54 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HMX2A2RU54 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMX2A2RU54 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms