Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms