Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YX20

TRBV7-6, T-cell receptor beta variable 7-6 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-6A0A0J9YX20 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRBV7-6A0A0J9YX20 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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TRBV7-6A0A0J9YX20 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV7-6A0A0J9YX20 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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TRBV7-6A0A0J9YX20 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV7-6A0A0J9YX20 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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