Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD54BQ9Y620 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms