Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U2

TSSC4, Protein TSSC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSC4Q9Y5U2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TSSC4Q9Y5U2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TSSC4Q9Y5U2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms