Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB12Q9Y5F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB12Q9Y5F1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms