Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAXBP1Q9Y5B6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PAXBP1Q9Y5B6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PAXBP1Q9Y5B6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms