Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KIF3AQ9Y496 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KIF3AQ9Y496 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KIF3AQ9Y496 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms