Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KNSTRNQ9Y448 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KNSTRNQ9Y448 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KNSTRNQ9Y448 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms