Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRG3Q9Y2Y8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRG3Q9Y2Y8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRG3Q9Y2Y8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms