Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATF5Q9Y2D1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF5Q9Y2D1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms