Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SCN8AQ9UQD0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN8AQ9UQD0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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