Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TNFSF18Q9UNG2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TNFSF18Q9UNG2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms