Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
L1RE1Q9UN81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
L1RE1Q9UN81 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms