Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN66

PCDHB8, Protocadherin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB8Q9UN66 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHB8Q9UN66 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB8Q9UN66 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms