Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX12Q9UMY4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNX12Q9UMY4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms