Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PADI4Q9UM07 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PADI4Q9UM07 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms