Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
HDAC9Q9UKV0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HDAC9Q9UKV0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms