Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU7

ACAD8, Isobutyryl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD8Q9UKU7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ACAD8Q9UKU7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ACAD8Q9UKU7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms