Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRDM4Q9UKN5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRDM4Q9UKN5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms