Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSKSQ9UJT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSKSQ9UJT2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSKSQ9UJT2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms