Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PHF11Q9UIL8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms