Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP25Q9UHP3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP25Q9UHP3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP25Q9UHP3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms