Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNTNAP2Q9UHC6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTNAP2Q9UHC6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms