Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX0

HESX1, Homeobox expressed in ES cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HESX1Q9UBX0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HESX1Q9UBX0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HESX1Q9UBX0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms