Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK2Q9UBU2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK2Q9UBU2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms