Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC17A7Q9P2U7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC17A7Q9P2U7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms