Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
REREQ9P2R6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
REREQ9P2R6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms