Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
KLHL13Q9P2N7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLHL13Q9P2N7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms