Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
COL20A1Q9P218 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COL20A1Q9P218 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms