Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HCN3Q9P1Z3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HCN3Q9P1Z3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms