Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHMP5Q9NZZ3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHMP5Q9NZZ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms