Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LMCD1Q9NZU5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LMCD1Q9NZU5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms