Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMOD2Q9NZR1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMOD2Q9NZR1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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