Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TVP23BQ9NYZ1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms