Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
ALKBH4Q9NXW9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ALKBH4Q9NXW9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms