Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GDAP2Q9NXN4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GDAP2Q9NXN4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms